Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ID3Q02535 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms