Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OC90Q02509 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OC90Q02509 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OC90Q02509 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OC90Q02509 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OC90Q02509 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OC90Q02509 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms