Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms