Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP27A1Q02318 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms