Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UFM1P61960 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UFM1P61960 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms