Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA1P59665 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA1P59665 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms