Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4BP1P59074 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4BP1P59074 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms