Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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