Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL3P58215 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms