Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA9P57773 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA9P57773 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJA9P57773 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJA9P57773 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJA9P57773 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms