Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms