Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSR4P51571 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSR4P51571 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSR4P51571 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms