Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA4P51532 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms