Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DAP3P51398 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DAP3P51398 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DAP3P51398 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DAP3P51398 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DAP3P51398 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms