Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FNTAP49354 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FNTAP49354 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FNTAP49354 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms