Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK1A1P48729 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms