Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NESP48681 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NESP48681 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NESP48681 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NESP48681 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NESP48681 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NESP48681 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NESP48681 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NESP48681 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NESP48681 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NESP48681 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NESP48681 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NESP48681 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NESP48681 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms