Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPOP42166 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms