Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms