Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP6V1E1P36543 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms