Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms