Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms