Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH4A1P30038 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms