Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD40LGP29965 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms