Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRABP1P29762 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRABP1P29762 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms