Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCAP28676 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCAP28676 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCAP28676 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCAP28676 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCAP28676 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCAP28676 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCAP28676 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCAP28676 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCAP28676 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCAP28676 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms