Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB9P28065 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms