Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms