Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA3P26006 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms