Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO1P25800 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO1P25800 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO1P25800 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms