Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRR1P24046 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms