Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3871.6 ms