Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CA6P23280 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CA6P23280 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CA6P23280 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CA6P23280 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CA6P23280 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CA6P23280 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CA6P23280 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CA6P23280 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CA6P23280 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms