Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTGS1P23219 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms