Protein–RNA interactions for Protein: P22680

CYP7A1, Cholesterol 7-alpha-monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP7A1P22680 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYP7A1P22680 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP7A1P22680 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms