Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF1P22415 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF1P22415 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USF1P22415 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USF1P22415 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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