Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms