Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPI1P17947 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPI1P17947 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPI1P17947 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms