Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VEGFAP15692 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms