Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODC1P11926 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODC1P11926 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODC1P11926 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms