Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHGAP10645 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHGAP10645 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHGAP10645 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHGAP10645 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHGAP10645 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHGAP10645 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHGAP10645 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHGAP10645 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHGAP10645 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms