Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCL3P10147 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCL3P10147 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms