Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms