Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN2P0C2S0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms