Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSD2O96028 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSD2O96028 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms