Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRMUO75648 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRMUO75648 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRMUO75648 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRMUO75648 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRMUO75648 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms