Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSVO60911 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSVO60911 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTSVO60911 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms