Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms