Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX15O60248 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms