Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms